Nova tema u X2 je jedinstvo", kako dvije generacije X-Mena udružuju snage s najnevjerojatnijim saveznikom da bi se borili protiv nove, i to ljudske, prijetnje. Kako priča počinje, mutanti nastavljaju svoju borbu za očuvanje društva koje se boji i koje im Ne vjeruje o Registraciji protumutantskog pokreta sada je William Stryker, imućni vojnik za kojeg se govori da eksperimentira s mutantima na neki način je povezan s tajnovitom i zaboravljenom prošlošću Wolverine u potrazi za svojim korijenima, Stryker pokreće svoj anti-mutantski program počevši s velikim vojnim ofenzivom na Xavierovu kuću i Školu za nadarene. Magneto, koji je uspio pobjeći iz plastičnog zatvora, predlaže saradnju sa X-Men u borbi protiv sadašnjeg zajedničkog neprijatelja, Strykera.

Prikaži više